拥有科学的散热通道同样是N96的一大特色，侧面板处理器位置以及机箱正下方预留出大面积栅孔，正/侧/背面均可安装有散风扇，（前板可安装120MM风扇、侧板可安装140/120MM风扇、后板安装90/80MM风扇）能最大程度上照顾到处理器、显卡、及PCI设备的全方位散热，而如果想再加大进风量的用户，还可以将风扇尺寸增大。从散热效果图可以看出，N96散热通道能科学高效地进行热冷空气的交换。